神石不能直接镶嵌在普通石头或任意装备上，正确操作是在庄园找到神石商人，把神石装入符合条件的觉醒装备孔位中。该功能通常需要开服达到30天后开放，进入庄园后点击神石商人，选择神石镶嵌，再从背包中选取目标装备和神石。可镶嵌神石的部位包括盾牌、面纱、勋章、玉佩、疗伤石和斗笠，武器、衣服以及没有觉醒属性的装备不能作为镶嵌对象。
镶嵌前必须先给觉醒装备开孔，未开启的孔位即使背包里有神石也无法放入。进入神石商人界面后，先点击装备，再查看孔位状态，显示锁定时使用传奇币开孔，显示空白或可用时才可以放入神石。每个部位通常有3个神石孔，六个部位合计18个孔位；常见规则下，单个部位全部开满需要90000传奇币，因此前期不建议一次性把所有孔位开完，优先投入正在穿戴、长期使用的觉醒装备更省资源。
神石的选择应按职业定位和战斗场景决定，而不是看到等级高就直接镶上。战士近距离打架可优先考虑提升生存、攻击或持续作战能力的属性，法师刷怪和群体输出可优先选择增强伤害、命中或技能收益的神石，道士则更适合兼顾生存、辅助和召唤相关收益；日常挂机以刷怪效率为主，优先输出属性，跨服战或沙巴克则应保留部分孔位给防御、减伤和抗控制方向的神石。属性相同但数值不同的神石，先比较实际加成，再考虑是否值得替换，低等级神石不必为了凑满孔位强行消耗大量资源。
实际操作时应按确认装备觉醒状态—开孔—选择神石—点击镶嵌—检查属性的顺序进行，镶嵌成功后重新打开装备详情，确认神石图标和属性已经生效。神石装入后，替换装备不会让已镶嵌的神石消失，但更换部位时仍要检查新装备是否属于可镶嵌的觉醒装备；多余神石可以在神石商人处回收为神石精华，也可以留给后续更换。常见误区是把神石当成铭文或普通宝石，直接在背包点击使用，或者没有开孔就反复尝试镶嵌，这两种操作都不会产生属性效果。
